我在前面已经提，在元朝就曾设置澎湖巡检司，负责台湾与澎湖列岛一带的海防与治安。但是了明朝初年，由海倭寇的猖獗，明政府撤销了澎湖巡检司一机构，并将澎湖列岛的居民撤往陆。明朝政府的一做法，不但有遏制倭寇的目的，反让澎湖列岛逐渐了倭寇的据点。
在明朝，台湾岛与陆的联系已经十分密切，有不少陆人渡海台湾岛居住。明朝虽有在岛设立行政机构，但明军在追剿“海寇”曾次进入台湾，并台湾及其附近海面列军防御区域。启二年（1622年），荷兰人二次被明朝军队从澎湖驱逐，便转向台湾，侵占了台南一带。启六年（1626年），西班牙人步荷兰人的尘，占据了台北一带。明朝末年，荷兰人趁在台湾中部的北港一带建有政权的郑芝龙（郑功父）将活动从台湾转向陆机，独占了台湾岛。
清顺治十八年（1661年），郑功因在陆抗清不利，决定改台湾基，因此他从厦门兵，前攻打台湾。二年初，荷兰侵略者投降，退了台湾岛。随，郑功他的儿子郑经在台湾澎湖设立了三安抚司属的府、州，建立了奉南明永历正朔的郑氏政权。
在清初的朝……（内容加载失败！）
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