六月初六，秦清离玉青园，由司礼监太监杨吕引导，从德胜门入，经承门步入内殿，召见群臣，查国库，此魏国库的存银已经不足百万。
秦清令让户部尚书秦远同刑部尚书景修，追缴国库一应欠款及被贪墨银两，命杨吕清查皇帝内库银两。凡贪墨人，严惩不贷。
秦清又令：“敢有伤人及掠人财物妇女者杀无赦。敢有哄抬粮价、囤积居奇者杀无赦。重新放漕运，调粮入京，平抑粮价，敢有从中贪墨吞者杀无赦。”
秦清三命令是清查各部库存，兵部、工部等衙门，有己的“库”，其中牵扯的银钱在百万数，此则由秦不二负责。
在秦的四位门客中，秦不三秦不四两人颠三倒四，不堪，秦不一秦不二却是颇有才具，完全胜任。
最，秦清委派礼部尚书梅盛林工部尚书霍四准备登基祭典的一应宜。
六月十五，秦清在帝京城外南郊举行登基典，祭告，定国号“玄”，寓意黑水源门的别称玄门，建元太平，改“载”“年”，册封白绣裳皇，立秦素皇太女。
秦清并未封功臣，他与群臣约定，待一统，太平，再行论功行赏。
玄太平元年，七月初五，秦清颁布《谕中原……（内容加载失败！）
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