冯国璋就任总统不久，就提议按照袁世凯设置陆海军元帅统率办处的例，在总统府立一“统率办公处”，王士珍处长。
段祺瑞一听马意识己的军权有被分割的危险：王士珍身兼参谋总长，一旦府院遇不同意见，冯国璋府方就坐拥三分二的数。
知段祺瑞不同意设立“统率办公处”，冯国璋又提议在总统府内设立“参陆办公处”，由参谋总长王士珍兼有陆军总长职务的段祺瑞共同负责。他托人带话给段祺瑞说：“请芝泉无须，总统军队的统帅，军不闻不问毕竟是失职嘛。”
段祺瑞闻言不便再拒绝，终同意设立一组织，但又坚持“参陆办公处”必须附在责任内阁面才算合法。他一手的高明处在，不仅使冯国璋实际无法分享国务院的军权，且参谋本部变了国务院的附属机构，从最程度限制了冯国璋联王抑段的。
些情况被一些老北洋人在眼，令他早早就今的府院关系存在某隐忧。任黑龙江省督军鲍贵卿在站练兵期即管带，他在进京谒见冯国璋，特秘书厅找恽宝惠攀谈。二人先谈了一黎段相争的情况，接着鲍贵卿便说：“他老兄弟俩（指冯段）有什……（内容加载失败！）
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