辽东司隶属山东指挥使司，相一的军分区，辖境南旅顺口，北至原，东临鸭绿江，西尽山海关，相的辽宁省的部分区，望青徐，引松漠，控海西女真，隔断蒙古与朝鲜，北望奴儿干，犹一巨手，翼护着明的东北方。
片区域，是洪武四年的候元辽阳行省平章刘益投降明才纳入明领土的，原设有三万卫、辽海卫两卫兵马，边关塞设立两平级并行的军政建制，在明全国是绝无仅有的。且两卫的兵力较普通的卫所的，普通的卫所约有兵马五千六百人，分五千户所。
三万卫领千户所八，辽海卫领千户所九。各设掌印指挥一员，管屯指挥一员，管局指挥一员，经历一员，镇抚一员，仓官一员，库官一员，驿官一员，递运所官一员，掌所印千户八员。见朝廷方的重视。
实际的驻军不两卫，有一卫兵马，叫做元中护卫。朱松受封韩王，朝廷就从禁卫亲军中抽调精锐组韩王护卫军，至元设立元中护卫所，并且在原建造韩王府，迎接韩王的，结果韩王嫌儿清苦，托病不，中护卫就眼巴巴等在儿。
此外，原设有原兵备，整饬兵备，主负责原城、中固……（内容加载失败！）
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