那一天，人类失去了半个世界——为阻挡「黑雾」的威胁而建造的巨大「高墙」划分地球，全世界有半数人口失去故乡。 为收容变成难民的人们而建造的人工都市「方舟」，现在已经以国家的形式成为人们的新故乡。 少数的日本人残存者之一，紫堂缘在第九号「方舟」经营侦探事务所。 他善用各种枪炮武器，能使用发动全身之「气」的紫堂流忍术。 某天，一桩追捕男性窃盗嫌疑犯的简单工作找上门来，但男人在缘面前揭露了自己的真正身分。 面对悄声袭来的巨大阴谋和组织，缘真的有胜算吗！？