「我将记录一切的记事本放入时光胶囊，深埋地底，千年后才能公开。 致千年后看到这封信的你，请问这个世界改变了吗？」 二十一世纪，人类文明灭绝，进入黑暗时代。 千年后，人类重建世界，但世界永远变了。 二〇一一年，科学家发现第一名拥有超能力的十九岁女性，她就如同促进全人类进步的新型结晶。多年后，日本的觉醒者－－少年A，在深夜撬开大楼锁头，残杀十七名女性，揭开世界反抗超能力者的序幕。全球出现多起暴力事件，超能力者组织起来，主张淘汰普通人，美国内战引爆全球战争。人类自相残杀，文明正式毁灭，进入了黑暗时代...